北京公司減少注冊資本的登記流程如下：

1. 經股東會決議通過。

2. 修改公司章程。注冊資本屬于公司章程應當載明的事項，所以在減資的時候要相應修改公司的章程。

3. 編制資產負債表以及財產清單。根據《公司法》第177條規定，公司需要減少注冊資本時，必須編制資產負債表及財產清單。 

4. 通知或者是公告債權人。注冊資本的減少在一定程度上會動搖公司的資本信用基礎，進而影響公司債權人的權利。因此，在減資時需要切實保護債權人的利益。對此，《公司法》第177條規定：公司應當自作出減少注冊資本決議之日起十日內通知債權人，并于三十日內在報紙上公告。

5. 辦理變更登記。

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